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环渤海红条毛肤石鳖(Acanthochitonrubrolineatus)种群遗传多样性研究
Genetic Diversity of Acanthochiton rubrolineatus in the Bohai Rim
曲江勇
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DOI:
作者单位:烟台大学
中文关键字:红条毛肤石鳖;生态遗传;遗传结构;细胞色素氧化酶亚基I
英文关键字:Acanthochiton rubrolineatus; ecological genetics; genetic structure; cytochrome oxidase subunit I
中文摘要:以线粒体细胞色素氧化酶亚基I(COI)为遗传标记分析了环渤海红条毛肤石鳖(Acanthochiton rubrolineatus) 9个种群的遗传多样性及遗传结构。126个个体经PCR 扩增测序获得654bp的COI基因序列,41个多态位点产生29种单倍型,总体单倍型多样性为0.899±0.013,核苷酸多样性为0.0133±0.0068。种群遗传多样性与纬度(r=-0.808, P<0.05)及年平均温度变异系数(r=-0.795, P<0.05)呈显著负相关,表明红条毛肤石鳖适宜低纬度及温度稳定的海洋环境。AMOVA分析表明,遗传变异主要发生在种群内(83.26%,P<0.001)。系统发生树与单倍型网络图没有呈现明显的谱系地理结构。种群历史动态结果显示,红条毛肤石鳖早更新世晚期(第二温暖期)间冰期经历了种群扩张。
英文摘要:The genetic diversity and genetic structure of 9 populations of Acanthochiton rubrolineatus in the Bohai Rim were analyzed using mitochondrial cytochrome oxidase subunit I (COI). 126 individuals were sequenced to obtain COI gene sequence of 654bp. A total of 29 haplotypes were detected by 41 polymorphic loci. The haplotype diversity of all samples was 0.899±0.013, and the nucleotide diversity was 0.0133±0.0068. There was a significant negative correlation between the population genetic diversity and latitudinal (r=-0.808, P<0.05) and annual mean temperature variation coefficient (r=-0.795, P<0.05), indicating that A. rubrolineatus was suitable for low latitudes and temperature stable marine environment. AMOVA analysis showed that genetic variation occurred mainly within populations (83.26%, P<0.001). Phylogenetic tree and haplotype network did not show obvious phylogeographic structure. Population demographic results showed that A. rubrolineatus had experienced population expansion during the late period of early Pleistocene (the second warm period) and interglacial period.
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